Да, должен.

В соответствии с п.п.4) п. 2 статьи 18 «Требования к членству в саморегулируемой организации аудиторов» Федерального закона Российской Федерации от 30 декабря 2008 г. N 307-ФЗ "Об аудиторской деятельности":

4) численность аудиторов в коллегиальном исполнительном органе коммерческой организации должна быть не менее 50 процентов состава такого исполнительного органа. Лицо, являющееся единоличным исполнительным органом коммерческой организации, а также индивидуальный предприниматель (управляющий), которому по договору переданы полномочия исполнительного органа коммерческой организации, должны быть аудиторами. В случае, если полномочия исполнительного органа коммерческой организации переданы по договору другой коммерческой организации, последняя должна быть аудиторской организацией;

Следовательно, если аудиторская организация возглавляется единоличным исполнительным органом – аудитором или аудиторской организации, он должен быть аттестованным аудитором.