Да, сохранит.
В соответствии со Статьей 4 «Аудитор» Федерального закона Российской Федерации от 30 декабря 2008 г. N 307-ФЗ "Об аудиторской деятельности":
1. Аудитор - физическое лицо, получившее квалификационный аттестат аудитора и являющееся членом одной из саморегулируемых организаций аудиторов.
2. Физическое лицо признается аудитором с даты внесения сведений о нем в реестр аудиторов и аудиторских организаций.
3. Аудитор, являющийся работником аудиторской организации на основании трудового договора между ним и аудиторской организацией, вправе участвовать в осуществлении аудиторской организацией аудиторской деятельности, а также в оказании прочих услуг, предусмотренных статьей 1 настоящего Федерального закона.
4. Индивидуальный аудитор вправе осуществлять аудиторскую деятельность, а также оказывать прочие услуги в соответствии со статьей 1 настоящего Федерального закона, если иное не предусмотрено настоящим Федеральным законом.
Таким образом, аудитор, не вступивший в саморегулируемую организацию аудиторов до 01.01.2010 года, НЕ СМОЖЕТ осуществлять аудиторскую деятельность, а также в оказании прочих услуг, предусмотренных статьей 1 ФЗ № 307-ФЗ.
Но данный факт НЕ ПОВЛИЯЕТ на действительность, имеющегося у аудитора аттестата.